Bu yazılımlardan korunmanın en etkin yolu, bunların bulaşmasına yol açan kullanıcı alışkanlıklarının önüne geçmektir. İnternet’te gezinirken her türlü uyarı veya soru penceresini onaylamak birçok gereksiz yazılımın yüklenmesine sebep olmaktadır. Bilgisayar uzmanlığı ve tecrübesi yüksek kişiler herhangi bir anti-spyware yazılım kullanmadan da sorunlardan uzak kalabilmektedirler. Bu nedenle herhangi bir web sayfasında karşılaşılan uyarı veya diyalog penceresinin ne istediği iyice anlaşılmadan ya da bilen birilerine sorulmadan onaylanmaması gerekmektedir.
Birçok virüs gibi spyware’ler de en çok kullanılan işletim sistemlerinin ve yazılımların açıklarını kullanarak yayılmaktadır. Bu nedenle birçok spyware sadece Internet Explorer ile web sayfalarında gezinirken kullanıcıların karşısına çıkacak şekilde tasarlanmıştır. Kullanıcıların, Internet Explorer yerine Firefox, Opera gibi ücretsiz ve daha az hedef alınan web tarayıcılarını kullanmaları birçok spyware’e karşı etkili olacaktır.
Buna ek olarak, bazı ücretsiz yazılımlar (İnternet hızlandırıcı, hızlı download, dosya paylaşım vs. yazılımları gibi) kendi fonksiyonlarının dışında spyware yüklemektedir. Hatta kendisinin anti-spyware yazılımı olduğunu ve bilgisayarı zararlı yazılımlardan temizleyeceğini iddia ederek bilgisiz kullanıcıları yanıltan ve böylece birçok bilgisayara kurulan spyware’ler de mevcuttur. Kullanıcılar bu tür ücretsiz bir yazılımı kurmadan önce İnternet’te hakkında spyware içerip içermediği yönünde araştırma yapmalı ya da başkalarından teknik destek almalıdırlar.